1. 中国欠发达地区经济发展研究院
中国欠发达地区经济发展研究院成立于2005年，属于985人文社科创新基地，以应用经济学、理论经济学、工商管理、管理科学与工程、公共管理（部分）、法学（部分）等一级学科为基础，以国家重点建设学科——技术经济及管理和国家“211工程”重点建设项目—现代技术经济及管理为主干，充分发挥重庆大学经济管理学科、法学学科（部分）与重庆大学优势工程学科群的交叉综合优势，将基础理论研究、应用基础研究与我国欠发达地区经济发展的关键问题研究相结合，从欠发达地区经济发展过程所需要解决的重大经济问题、管理问题和法律问题出发，注重研究成果的前瞻性和实用性的结合，围绕我国欠发达地区经济发展的前沿理论问题和急需解决的关键问题，凝聚学科方向，改善研究条件，努力建设国内一流、国际先进的中国欠发达地区经济发展创新研究平台和创新研究团队，并为中国欠发达地区的经济发展提供适用的、具有可操作性的政策建议和工具平台。
2. 重庆大学—沃顿联合金融研究中心
2013年，重庆大学经济与工商管理学院（以下简称为重大经管学院），与美国宾夕法尼亚大学沃顿商学院（全球创立最早、世界排名顶尖的商学院）共同建立重庆大学-沃顿联合金融研究中心。该中心借助沃顿商学院和重大经管学院的优势资源，结合我国特别是重庆地区经济社会发展的新需要，在金融制度创新、金融市场结构、公司金融与公司治理等重点领域开展高水平的合作研究，并组织开办高端金融人才教育项目，以进一步提高重大经管学院国际化水平，推动人才培养和学科建设，并为重庆市建设区域性金融中心做出应有贡献。
3. 重庆大学工商管理与经济发展研究中心
重庆大学工商管理与经济发展研究中心设在重庆大学经济与工商管理学院,于2003年3月被批准为重庆市人文社会科学重点研究基地。基地自批准成立以来，在重庆市教委的业务监管和基地学术委员会的指导下，在重庆大学的领导和关怀下，在国内外同行的大力支持下，本中心根据基地的建设标准，围绕国家发展战略，针对学科前沿和重庆社会经济发展中的重大理论与实践问题，组织了高水平研究的新型科研组织。在产出创新成果，形成学术交流开放平台，带动重庆高校哲学社会科学发展创新等方面发挥重要作用。
4. 现代物流重庆市重点实验室
现代物流重庆市重点实验室是2010年9月由重庆市科委批准建设的市级重点实验室，依托建设单位为重庆大学经济与工商管理学院。实验室用房面积2500平方米，图书资料室600平方米。围绕现代物流的学科发展方向，结合重庆市经济建设和社会发展的现实需求，现代物流重庆市重点实验室主要在现代物流与供应链理论与方法、现代物流与先进制造业协同、物流信息系统及物流流程优化、逆向物流基础理论与应用开展教学科研工作。经过多年的建设，已经形成了稳定的研究队伍，并取得了丰硕的教学和科研成果。
5. 重庆大学能源技术经济研究院
重庆大学能源经济研究院成立于2008年，依托重庆大学“技术经济与管理”与“电气工程”等与能源领域密切相关的国家重点学科，在“电力经济”研究方向的基础上整合节能减排、新能源开发利用等领域涉及制度、政策的研究。下设5个研究方向：能源环境与经济发展、能源战略与产业组织、能源产业投融资与评价方法、能源市场与企业体制改革、能源企业管理与优化决策。
6. 重庆旅游人才发展研究院
根据重庆市旅游局与重庆大学2012年底签署的《关于共同推进“科教兴旅 人才强旅”战略合作协议》，重庆大学于2014年1月9日发文成立了“重庆旅游人才发展研究院”。研究院为局校合作机构；按学校“重大校〔2014〕12号”文通知，研究院作为科研机构挂靠经济与工商管理学院，龙勇兼任研究院院长。
研究院的主要任务是为重庆市培养旅游产业与旅游事业发展所需的高端人才，依托工商管理、应用经济学和风景园林学三个一级学科博士点招收博士生，并依托MBA/EMBA项目、高端培训项目培养旅游专业人才。同时，承担重庆市人民政府、重庆市旅游局相关旅游研究与咨询服务工作。
研究院现有博导6人，硕导和教师12人；涉及旅游战略规划、旅游电子商务、旅游产业经济、旅游金融和风景园林规划等研究方向；龙勇教授为对口旅游产业的重庆市人民政府决策咨询专家；龙勇、蒲勇健教授为重庆旅游经济顾问。研究院自成立以来，已招收培养博士生13人，硕士生20余人；开展专项培训4次；主持旅游研究课题11项，参与省部级旅游规划项目评审20余项；发表国内外重要期刊论文50余篇；被评为重庆市旅游系统先进集体。
7. 重庆大学—蓝洋金融研究中心
2013年，为支持重庆大学教育事业发展，加强学校与优秀企业合作，发挥学院研究特长为企业发展提供智力支持，重庆蓝洋融资担保股份有限公司向重庆大学教育基金会捐赠，在重庆大学经济与工商管理学院设立“蓝洋研究基金”，成立“重庆大学-蓝洋金融研究中心”，致力于金融学科前沿学术研究，促进学校金融学科的发展。
8. 重庆大学证券研究所
重庆大学证券研究所成立于1995年，首任所长为经济与工商管理学院资深教授、博士生导师杨秀苔先生。第二任所长为重庆大学副校长、经济与工商管理学院教授、博士生导师孟卫东博士。目前，第三任所长为经济与工商管理学院金融系教授、博士生导师周孝华博士，副所长为金融系教授、博士生导师陈其安博士、宋增基博士，以及其它固定成员有会计系教授、博士生导师刘斌博士、辛清泉博士，金融系副教授、博士皮天雷、吴俊、涂国前，讲师周红军博士。
重庆大学证券研究所主要职能是：第一，强化我校在股票、债券等有价证券及资本市场与投融资方面的深入研究，并更好地服务于相关学科的教学；第二，进一步扩大并加强与证券业界的交流合作；第三，积极参与企业债、地方债、国债等债务证券化方面的研究及政府决策咨询，以扩大学校在相关领域及行业方面的影响。
9. 重庆大学财务与会计研究中心
重庆大学财务与会计研究中心成立于2010年，由国家自然科学基金重点项目负责人、首席专家以及国务院学位委员会学科评议组专家刘星教授领衔。该研究中心以重庆大学经济与工商管理学院的“会计学”、“工商管理”和“金融学”学科为依托，立足中国国情，强调国际视野，围绕“中国经济转型背景下的公司财务、公司治理和会计信息问题”展开深入的理论研究与实证分析,丰富和拓展适用于新兴和转型情景下的公司财务与治理理论，并为国际学术界贡献来自中国资本市场的逻辑和证据。
