现代物流重庆市重点实验室的总体定位和目标为：建设具有国内一流水平的现代物流科学研究基地，为进一步申报国家级重点实验室或教育部人文社科重点研究基地(国家级)创造条件；在现代物流与供应链理论与方法、现代物流与先进制造业协同、物流信息系统及物流流程优化、逆向物流基础理论与应用等方面形成具有核心竞争力的高水平的研究队伍和研发能力；解决相关领域的关键科学问题和技术难题；取得具有一定国际影响力和国内领先水平的研究成果；推动现代物流领域基础理论和应用技术的发展；为重庆市“314”总体部署和统筹城乡发展战略的实施提供支撑，促进重庆市国民经济建设与发展。